microRNA(miRNA)是一類(lèi)小片段單鏈RNA , 最初是在核內由RNA聚合酶轉錄形成具有帽子結構(7MGpppG)和多聚腺苷酸尾巴(AAAA)的pri-miRNA,pri-miRNA在核酸酶Drosha及其輔助因子Pasha的作用下被處理成約70個(gè)核苷的pre-miRNA。pre-miRNA被運輸出核后再由另外一個(gè)核酸酶Dicer將其剪切形成約22個(gè)核苷酸的成熟miRNA。成熟的miRNA 與RISC組裝成RNA誘導的沉默復合體,通過(guò)堿基互補配對的方式識別靶mRNA,并根據互補程度的不同指導沉默復合體降解靶mRNA或者阻遏靶mRNA的翻譯。
圖示1:miRNA的成熟過(guò)程
★ 服務(wù)內容
2:miRNA的抑制
1:miRNA 的過(guò)表達慢病毒包裝
我公司采用擴增pri-miRNA及其兩端的天然側翼序列來(lái)構建miRNA的過(guò)表達質(zhì)粒,并包裝慢病毒。以實(shí)現miRNA在體外(內)的高表達。該方法相比化學(xué)合成的miRNA,具有可持續性表達,并且能用于難轉染(例如干細胞,懸浮細胞等)細胞等優(yōu)點(diǎn)。比pre-miRNA和mature miRNA 形式的過(guò)表達,具有表達效果更好,更能模擬體內天然的成熟過(guò)程。
我公司采用TuD RNA(Tough Decoy RNA)的設計方法構建miRNA的抑制慢病毒載體。TuD RNA不同于以往的單鏈RNA,它是含有頸環(huán)結構的雙鏈RNA , 能夠抵抗胞內核酸酶的降解,讓miRNA抑制可持續一個(gè)月以上。并且,TuD RNA的兩條鏈都包含一個(gè)miRNA結合位點(diǎn),能夠更高效地隔離濃度較低的目標miRNA。因此,相比其它方法,TuD RNA能夠更長(cháng)效的抑制miRNA。
圖示2:TuD RNA的工作原理
3:miRNA的靶基因驗證
由于miRNA是通過(guò)其seed sequence(5’端2-8位核苷酸)與靶基因的3’UTR結合抑制靶基因的表達。因此,我們將待定目的基因的3’UTR區域構建至報告基因luciferase的后面,通過(guò)比較實(shí)驗組和對照組報告基因表達的改變(監測熒光素酶的活性變化)來(lái)間接反映miRNA對目的基因的抑制作用。同時(shí)結合定點(diǎn)突變等方法進(jìn)一步確認miRNA與靶基因3’UTR的作用位點(diǎn)。
★ 服務(wù)說(shuō)明
1:客戶(hù)只需提供miRBase數據庫中的miRNA編號,我們就可以按照您的要求完成相關(guān)實(shí)驗。
2:miRNA的過(guò)表達效果受諸多因素影響,與對照組相比,可以提高2—1000倍(如果本底表達水平較低,可以達到較好的過(guò)表達效果,如果本底表達水平較高,過(guò)表達效果會(huì )相對較低)。
3:我們提供多個(gè)microRNA慢病毒載體供客戶(hù)選擇(見(jiàn)下方載體信息);
★ 客戶(hù)所得
1:符合客戶(hù)要求的產(chǎn)品(質(zhì)粒+甘油菌 或者 病毒+polybrene);
2:完整的電子版實(shí)驗報告(包括實(shí)驗材料,步驟,載體圖譜等);
3:完整的測序報告;
載體編號 |
攜帶標記 |
載體骨架主要元件 |
|
熒光 |
真核抗性 |
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MicroRNA過(guò)表達慢病毒載體 |
|||
pHY-LV-miR1.1 |
無(wú) |
無(wú) |
CMV-GFP-MCS |
pHY-LV-miR1.2 |
GFP |
無(wú) |
CMV-GFP-MCS-PGK- Puromycin |
MicroRNA抑制慢病毒載體 |
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pHY-LV-KD1.1 |
GFP |
無(wú) |
U6-TuD RNA-CMV-GFP |
pHY-LV-KD1.2 |
RFP |
無(wú) |
U6- TuD RNA -CMV-RFP |
pHY-LV-KD1.4 |
無(wú) |
puromycin |
U6- TuD RNA -CMV-Puromycin |
pHY-LV-KD2.1 |
GFP |
無(wú) |
U6- TuD RNA -EF1α-GFP |
pHY-LV-KD3.1 |
GFP |
無(wú) |
U6- TuD RNA -UBC-GFP |
pHY-LV-KD5.1 |
GFP |
puromycin |
U6- TuD RNA -CMV-GFP-PGK- Puromycin |
pHY-LV-KD5.2 |
RFP |
puromycin |
U6- TuD RNA -CMV-RFP-PGK- Puromycin |
pHY-LV-KD5.4 |
GFP |
puromycin |
U6- TuD RNA -UBC-GFP-PGK- Puromycin |
3’UTR報告基因慢病毒載體 |
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pHY-LV-Report3.1 |
luciferase |
無(wú) |
CMV-luciferase-MCS |